Expertin
Dr. rer. nat. MSc BSc Birgit Waldner

Expertise

  • Medizinische Chemie, Medizinische Physik, Physiologie: Expertin in der multivariaten Datenauswertung und der Erstellung personalisierter Apps mit Shiny-R. Erfahrung im Deep Learning mit Python und R. Expertise sowohl im Bereich der praktischen medizinischen Chemie durch Diplomarbeit im Bereich der Synthese bioaktiver Substanzen und Testung derselben als auch in der theoretischen Chemie durch Arbeit als Projektmitarbeiterin im Projekt \"Molecular Determinants of Serine Protease Specificity\". Zusätzlich Mitarbeit in Nebenprojekten mit Schwerpunkt Protease-Spezifität innerhalb und außerhalb EU. Weiters Expertin für Glasfaser/Epoxid-Harz Faserverbundwerkstoff durch Masterarbeit im Rahmen des Masterstudiums Material- und Nanowissenschaften.
  • Wirtschaftswissenschaften: Expertise im Bereich Controlling und Rechnungswesen durch Bachelorstudium Wirtschaftswissenschaften mit Schwerpunkt Controlling und Halten von Kursen im Bereich Rechnungswesen für Studenten der Wirtschafts- und Rechtswissenschaften am IFS Innsbruck.
  • Informatik: Expertise im Bereich des High Performance Computing und Programmieren in C# und Python durch Arbeit als Projektmitarbeiterin in der theoretischen Chemie. Expertin in der multivariaten Datenauswertung und Deep Learning mit Python durch Tätigkeit als Bioinformatikerin bei der Firma Bionorica research.

Verfügbar für

    Kooperationen
    Mentoring
    Projektleitung
    Projektmitarbeit
    Vortragstätigkeiten

Beruflich

Tätigkeitsbereiche:
  • Universität

Ausbildung

Universität (2018)
Chemie

Zusatzausbildung(en)
Dr rer. nat. in Theoretischer Chemie, Schwerpunkt theoretische Strukturbiologie. Neben dem Studium der Technischen Chemie an der Technischen Universität Wien auch Besuch von Vorlesungen und Übungen des Studienganges \"Medizinische Informatik\".

Weitere Fachrichtungen, weitere Ausbildungen
Bachelor in Management und Economics, abgeschlossen 2014. Master in Material- und Nanowissenschaften, Abschluss 2017.

Sprachen

  • Deutsch
  • Englisch
  • Französisch
  • Italienisch
  • Portugiesisch / Brasilianisch
Mehr Details
  • Deutsch

    Schriftlich: Muttersprache / wie Muttersprache
    Konversation: Muttersprache / wie Muttersprache

  • Englisch

    Schriftlich: Muttersprache / wie Muttersprache
    Konversation: Muttersprache / wie Muttersprache

  • Französisch

    Schriftlich: Gute Kenntnisse
    Konversation: Grundkenntnisse

  • Italienisch

    Schriftlich: Muttersprache / wie Muttersprache
    Konversation: Muttersprache / wie Muttersprache

  • Portugiesisch / Brasilianisch

    Schriftlich: Gute Kenntnisse
    Konversation: Gute Kenntnisse

Referenzen

Auszeichnungen / Preise

\"Leistung sichtbar machen und belohnen\" - Stiftung Sparkasse Südtirol \"Würdigungspreis\" - Bundesministerium für Wissenschaft und Forschung, Österreich \"DOC-Stipendium\" - Akademie der Wissenschaften.

Publikationen

"On the Performance of Film Formers versus Penetrants as Water-repellent Treatment of High-Performance Concrete (HPC) Surfaces", Bader, T., Waldner, B. J., Unterberger, S. H., & Lackner, R., Construction and Building Materials (2019), 203, 481-490. DOI: 10.1016/j.conbuildmat.2019.01.089

 

 "Understanding Structure–Activity Relationships for Trypanosomal Cysteine Protease Inhibitors by Simulations and Free Energy Calculations", Santos, L. H., Waldner, B. J., Fuchs, J. E., Pereira, G. A., Liedl, K. R., Caffarena, E. R., & Ferreira, R. S., Journal of chemical information and modeling (2018), 59(1), 137-148. DOI: 10.1021/acs.jcim.8b00557

 

"Electrostatic Recognition in Substrate Binding to Serine Proteases", Waldner, B. J., Kramml, J., Kahler, U., Spinn, A., Schauperl, M., Podewitz, M., Fuchs, J. E., Cruciani, G., Liedl, K. R., Journal of Molecular Recognition (2018), 31(10), e2727. DOI: 10.1002/jmr.2727

 

"A Binding Pose Flip Explained via Enthalpic and Entropic Contributions", Schauperl, M., Czodrowski, P., Fuchs, J. E., Huber, R. G., Waldner, B. J., Podewitz, M., Kramer, C., Liedl, K.R., Journal of Chemical Information and Modeling (2017), 57(2), 345-354. DOI: 10.1021/acs.jcim.6b00483

 

"Enthalpic and Entropic Contributions to Hydrophobicity", Schauperl, M., Podewitz, M., Waldner, B. J., & Liedl, K. R., Journal of Chemical Theory and Computation (2016), 12(9), 4600-4610. DOI: 10.1021/acs.jctc.6b00422

 

"Protease Inhibitors in View of Peptide Substrate Databases", Waldner, B. J., Fuchs, J. E., Schauperl, M., Kramer, C., & Liedl, K. R., Journal of Chemical Information and Modeling (2016), 56(6), 1228-1235. DOI: 10.1021/acs.jcim.6b00064

 

"Quantitative Correlation of Conformational Binding Enthalpy with Substrate Specificity of Serine Proteases", Waldner, B. J., Fuchs, J. E., Huber, R. G., von Grafenstein, S., Schauperl, M., Kramer, C., & Liedl, K. R., The Journal of Physical Chemistry B (2015), 120(2), 299-308. DOI: 10.1021/acs.jpcb.5b10637

 

"Synthesis of Endo‐and Exo‐N‐Protected 5‐Arylated 2‐Aminothiazoles through Direct Arylation: An Efficient Route to Cell Differentiation Accelerators", Dao‐Huy, T., Waldner, B. J., Wimmer, L., Schnuerch, M., & Mihovilovic, M. D., European Journal of Organic Chemistry (2015), 2015(21), 4765-4771. DOI: 10.1002/ejoc.201500283

 

"Dynamics Govern Specificity of a Protein-Protein Interface: Substrate Recognition by Thrombin", Fuchs, J. E., Huber, R. G., Waldner, B. J., Kahler, U., von Grafenstein, S., Kramer, C., & Liedl, K. R., PloS One (2015), 10(10), e0140713. DOI: 10.1371/journal.pone.0140713

"Characterizing Protease Specificity: How Many Substrates Do We Need?" Schauperl, M., Fuchs, J. E., Waldner, B. J., Huber, R. G., Kramer, C., & Liedl, K. R., PloS One (2015), 10(11), e0142658. DOI: 10.1371/journal.pone.0142658

"Independent Metrics for Protein Backbone and Side-Chain Flexibility: Time Scales and Effects of Ligand Binding", Fuchs, J. E., Waldner, B. J., Huber, R. G., von Grafenstein, S., Kramer, C., & Liedl, K. R., Journal of Chemical Theory and Computation (2015), 11(3), 851-860. DOI: 10.1021/ct500633u

"Synthesis of 5-Arylated N-Arylthiazole-2-Amines as Potential Skeletal Muscle Cell Differentiation Promoters", Schnürch, M., Waldner, B., Hilber, K., & Mihovilovic, M. D Bioorganic & Medicinal Chemistry Letters (2011), 21(7), 2149-2154. DOI: 10.1016/j.bmcl.2011.01.123

 

"Studying Competitive Lithiations at Alpha-, Ortho-, and Benzylic Positions in Various N-Protected Aniline Derivatives", Schmid, M., Waldner, B., Schnürch, M., Mihovilovic, M. D., & Stanetty, P. Tetrahedron (2011), 67(16), 2895-2904. DOI: 10.1016/j.tet.2011.02.056

Birgit Waldner
Dr. rer. nat. MSc BSc Birgit Waldner

Medizinische Universität Innsbruck

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Letzte Aktualisierung: 10.09.2019